مكتب المعاهدات والاتفاقيات والتعاون الدولي ويختص بما يلي:-

-  دراسة الاتفاقيات ومدونات القواعد البحرية الدولية وتعديلاتها وتقديم التوصيات بشأن موقف الجماهيرية العظمى منها.

-  بحث ومتابعة متطلبات الاتفاقيات والقواعد البحرية الدولية النافذة في مجال السلامة البحرية وحماية البيئة.

-  متابعة وتنسيق شئون المنظمات والهيئات البحرية الدولية والإقليمية المختصة وتزويد الجهات ذات العلاقة بما يصدر عنها من وثائق وبيانات تتصل بأعمالهم.

-  دراسة وثائق المنظمات والهيئات البحرية الدولية والمحلية بشأن انعقاد الاجتماعات الدورية وتجهيز البيانات والمعلومات وتقديم التقارير والملاحظات اللازمة في الخصوص.

-   توثيق الاتفاقيات والبروتوكولات الدولية والعربية والإقليمية والعمل على توظيفها فيما يخدم القطاع.

-  الترتيب لعقد المفاوضات واتخاذ التدابير اللازمة لعقد الاجتماعات الثنائية المشتركة وتقديم التوصيات اللازمة بشأنها.

-  مراجعة ودراسة الاتفاقيات الثنائية المشتركة في مجال البحرية التجارية وتقديم الملاحظات اللازمة حيالها ومتابعتها بالتنسيق مع مكتب الشئون القانونية.

-   متابعة شئون التعاون الثنائي ومحاضر اجتماعات اللجان المشتركة في مجال اختصاصات المصلحة.

-  إعداد وتقديم الدراسات والتقارير بشأن الاتفاقيات الثنائية وحسب المقتضى والعمل على تطويرها بما يخدم مصلحة القطاع.

-  الاستفادة من مساهمة التعاون الثنائي الإقليمي في خلق فرص لتدريب وتأهيل العاملين بالقطاع بما لا يتعارض مع اختصاصات مكتب التدريب والتطوير.

-  التنسيق مع المنظمة البحرية الدولية (IMO)  في إخطار المصلحة بمواعيد اجتماعات المنظمة وتعميمها على الإدارات والمكاتب أولاً بأول بغية التحضير لها كلاً فيما يخصه.